Muzeja krājums sācis veidoties jau 1995. gadā, kad tika izveidot 1991. gada barikāžu dalībnieku atbalsta fonds. Saskaņā ar muzeja misiju krājuma darba mērķis ir komplektēt, saglabāt, darīt pieejamu sabiedrībai muzeja krājumu, ko veido ar valstiskās neatkarības atjaunošanos saistītais materiālās un garīgās kultūras mantojums. Muzejs krājumā uzņem dažāda veida materiālus, kas liecina par 1991. gada janvāra un augusta notikumiem, kā arī Atmodas laiku kopumā.

Muzeja krājumā reģistrēti gandrīz 10 000 glabāšanas vienību. Krājuma lielāko daļu veido barikāžu dalībnieku foto un video liecības – gan profesionāļu, gan amatieru uzņēmumi, kā arī fotogrāfijas un videomateriāli par citiem Atmodas laika notikumiem. Tāpat muzeja krājuma pieejami arī lietiski (plakāti, karogi, atšķirības zīmes, barikāžu aprīkojums, sadzīves priekšmeti, u.c.), rakstiskie (dokumenti, rokraksti un iespieddarbi) un cita veida tēlojošie priekšmeti.